Пцр расшифровка аббревиатуры

Пцр расшифровка аббревиатуры

ПЦР позволяет обнаруживать любые ДНК и РНК, даже когда бессильны другие методы. Безусловно, ПЦР — мощный и эффективный диагностический инструмент, позволяющий быстро и точно найти возбудителей очень многих инфекций.

ПЦР — это метод лабораторной диагностики, направленный на выявление возбудителей инфекционных заболеваний. Трёхбуквенный вариант — это аббревиатура названия «полимеразная цепная реакция». Собственно, в этом названии и отражается суть метода, но для того, чтобы разобраться, придётся основательно вспомнить школьный курс биологии.

Но сначала – немного истории. Метод ПЦР был разработан в 1983 году Кэри Мюллисом, за что он был удостоен Нобелевской премии. Изначально метод использовался в основном для научных целей, но затем, разглядев его перспективность и эффективность, метод стали продвигать в практическую медицину.

В литературе очень часто встречается такое образное описание ПЦР: это метод, с помощью которого учёные могут находить иглу в стоге сена и затем строить стог из этих игл. В принципе, очень точное описание. Если продолжать сравнение, то игла – это небольшой участок генетического материала микроорганизма, а стог сена – это организм человека, в котором данный микроорганизм поселился.

Что показывает анализ ПЦР

Анализ позволяет обнаружить присутствие генетического материала инфекционных возбудителей. ПЦР в гинекологии и в урологии широко применяется для выявления скрытых и труднодиагностируемых инфекций. В том числе выполняется ПЦР и на ВИЧ.

Принцип работы

За генетическую информацию в живом организме любого размера отвечает ДНК — двухспиральная дезоксирибонуклеиновая кислота, состоящая из последовательности четырех нуклеотидов, которые принято обозначать буквами А (аденин), Г (гуанин), Т (тимидин) и Ц (цитозин). Одно из основных правил генетики – правило комплементарности, то есть нуклеотиды соседних спиралей ДНК соединяются только в определеном порядке: А с Т, Г с Ц, и никак иначе.

У каждого живого создания (бактерия, вирус, рыба, зверь) – своя ДНК, причём для выявления конкретного организма достаточно иметь лишь небольшой участок этого хранилища генетической информации. Некоторые виды микроорганизмов, например, вирус иммунодефицита человека, хранят генетическую информацию в другой нуклеиновой кислоте – РНК, но и её фрагменты можно находить с помощью ПЦР.

Именно на обнаружении этого небольшого, но уникального для каждого отдельного организма участка и построен принцип ПЦР. Для каждого возбудителя создан свой специфический генетический детектор, эталонный фрагмент ДНК, который по принципу комплементарности точно обнаруживает «свой» фрагмент ДНК и запускает реакцию создания огромного количества его копий.

Один цикл ПЦР длится около трёх минут, количество копий растёт в геометрической прогрессии. Таким образом, за несколько часов количество фрагментов увеличивается в несколько миллиардов раз. Понятно, что теперь определить, какой возбудитель у данной конкретной инфекции, достаточно легко.

Достоинства

Теория – это, безусловно, замечательно, но что мы имеем на выходе? Какую практическую выгоду получает человек, когда отправляется на поиски вредоносных микроорганизмов, вооруженный ПЦР?

  • Безусловно, одно из главных достоинств — это универсальность метода. ПЦР позволяет обнаруживать любые ДНК и РНК, даже когда бессильны другие методы. Оборудование, используемое для ПЦР, стандартно, оно не зависит от того, что именно и где именно мы ищем.
  • Следующий плюс — высокая специфичность. В материале, направленном на исследование, определяется уникальная последовательность нуклеотидов, характерная только для конкретного возбудителя. Таким образом, можно говорить, что специфичность метода достигает 100%. Кроме того, это позволяет одновременно, в одном и том же материале, проводить поиск нескольких возбудителей без какого-либо ущерба для качества ответа.
  • Метод обладает высочайшей чувствительностью – мы уже говорили о том, что возможно найти всего один фрагмент генетического материала возбудителя.
  • Несомненное преимущество метода – оперативность. Постановка реакции занимает несколько часов, таким образом, вся диагностика, от момента сдачи материала на анализ до получения результата, отнимет всего один день.
  • При помощи ПЦР определяют возбудителя , а не реакцию на его внедрение со стороны организма. Таким образом, появилась возможность точно диагностировать заболевание еще в инкубационном периоде, когда нет никаких клинических или лабораторных признаков болезни.

Недостатки

Безусловно, ПЦР не идеальный метод, имеются и свои недостатки. Но они напрямую связаны с его достоинствами и с так называемым «человеческим фактором». ПЦР – очень высокотехнологичный метод, требующий соблюдения строжайших правил оснащения лаборатории. Достаточно сказать, что в помещении должен быть установлен фильтр биологической очистки со степенью 99,9%. Это связано с тем, что в воздухе постоянно присутствует невероятный коктейль из фрагментов ДНК всевозможных живых организмов, и в процессе подготовки к проведению реакции образец может быть загрязнен — возможно «ложное срабатывание».

Оценивать результаты реакции должен практический врач, который лечит конкретного больного. Дело в том, что далеко не всегда положительный ответ теста означает наличие заболевания. Например, человек пролечился от какого-либо заболевания, но погибший и уже не опасный возбудитель будет еще некоторое время «разбираться на запчасти» защитной системой организма. Если в этот момент сделать ПЦР – результат окажется положительным.

Читайте также:  Нехватка сладкого в организме

Другой вариант – это отрицательный результат ПЦР при наличии даже явной клинической картины. Одна из наиболее возможных причин – материал для исследования был взят «не оттуда». Образец должен брать квалифицированный врач, строго следуя инструкции, которую ему дает лаборатория.

Когда нужно делать?

Когда следует бежать в лабораторию, чтобы проанализировать итоги вашего летнего отпуска? Специалисты советуют делать это в следующих случаях: выделения, зуд, чувство жжения в области половых органов, резко изменившийся запах от половых органов, дискомфорт при мочеиспускании, необычный характер выделений (цвет, количество, консистенция), случайный половой контакт без применения презерватива.

Безусловно, ПЦР — мощный и эффективный диагностический инструмент, позволяющий быстро и точно найти возбудителей очень многих инфекций. Чаще всего его используют для диагностики именно заболеваний, передающихся половым путем. Причём зачастую клиники и лаборатории уже предлагают своеобразные готовые «наборы» ПЦР на ИППП — 5 инфекций, 13 инфекций. В этих случая обычно материалом для исследования является мазок. Например, мазок на хламидии у женщин берут из влагалища, у мужчин — из уретры. Для анализа биоматериалом могут быть и слюна, и кровь, и моча, и выделения половых органов.

В любом случае нельзя ограничиваться только одним методом. Лучше всего комбинировать различные методы исследования – помимо определения самого возбудителя методом ПЦР необходимо оценивать и иммунный ответ организма, который определяется традиционными уже серологическими методами, например, ИФА.

И помните: положительный ответ любого, даже самого современного лабораторного исследования – это повод не для паники, а для визита к врачу.

Выпускающий редактор — Филиппова Галина

Полимеразная цепная реакция (PCR)

Полимеразная цепная реакция это технология позволяющая выделить из двойной спирали ДНК участок с конкретным геном, размножить его и изучить. Открытие ПЦР в биологии и генетике, по своей значимости можно сравнить с изобретением микропроцессора в мире компьютерных технологий. Новые возможности, которые дала методика, взбудоражили научный мир.

Методика вдохнула новую жизнь в молекулярно-генетические исследования, и сделал возможными многие тестирования, которые по разными причинам были не выгодны, или не доступны широким массам.

Плюсы и минусы

Как и большинства сложных и высоких технологий, у полимеразного метода присутствуют, как достоинства, так и недостатки. В двух слова;

  1. Превосходная точность результатов исследования. Если вся технология соблюдена в точности, то вероятность ошибки в результатах стремится к сотым долям процента.
  2. Обширный выбор материалов для анализа. Полимеразная цепная реакция позволяет извлечь из образца любой генетический материал, который может в нём содержаться. Благодаря этому можно с равным успехом исследовать образцы слюны, крови, волос (с луковицами), ногтей, окурков от сигарет т.д.
  3. Сверхраннее диагностирование. Других универсальных методик способных обнаружить любую известную инфекцию на ранней стадии, до возникновения симптомов инфекционного заболевания, нет. Эта же методика, позволяет обнаружить дремлющие наследственные болезни, которые проявляют себе в разных поколениях по разному.
  4. Один метод ПЦР породил множество тестов, отвечающих разным тематикам исследований во многих отраслях человеческой деятельности.
  1. Высокая стоимость. Конечно тестов много, и стоят они по-разному, но самые информативны исследования всё ещё стоят не дешево. Но стоит учитывать, что всего за пару десятилетий технология сделала скачек стоимости в 100.000$ за полное исследование ДНК одного человека в лаборатории США, до ценника в районе 20-30 тысяч рублей в вашем или соседнем городе.
  2. Нехватка специалистов высокого уровня профессиональной подготовленности. Отчасти это сказывается и на конечной стоимости тестирования – генетика отрасль относительно молодая и развивающаяся. Общество не успевает изменяться под новые потребности в специалистах, как и само медленно привыкает к новым услугам и инновациям.
  3. Результаты теста будут искаженны, если образец для исследования был случайно или намеренно загрязнён. Тот момент, когда в очередной раз кажется, что безупречность почти достигнута. Но точность анализа настолько высока, что это является её плюсом и минусом одновременно.

Кому нужна диагностика

Поскольку ПЦР позволяет выявить даже мигрирующие из поколения в поколение наследственные заболевания в их скрытой фазе, провести такое исследование наверно будет полезно каждому. Конечно, не всем такие знания кажутся насущными и необходимыми здесь и сейчас, Но, думается, что по мере развития цивилизации будут расти и успехи медицины и генетики. А новые открытия позволят далеко продвинуться в достижении долголетия и здоровья. К тому момент, тест на наследственность вполне может стать обыденным и обязательным для всех анализом.

Пока же этого не случилось, чаще всего тест необходим в таких случаях:

  1. При возникновении подозрений о получение заболевания половым путем, или через укол, попадание зараженной крови на слизистые или открытые раны (достаточно небольшого пореза), нападение диких и одичавших животных, случайная травма об окружающие предметы, например, наступить в поле на старый гвоздь.
  2. Для уточнения диагноза, сделанного иными средствами, особенно в случаях, когда лечение даёт не специфическую реакцию организма.
  3. Для установления родственных связей для заявления прав на наследство, или в алиментной тяжбе.
  4. Для идентификации личности человека.
Читайте также:  К чему глаз правый чешится

Остальные тестирование больше относятся к сферам индивидуальных интересов. Кому интересно узнать, что показывает расшифровка всех народностей в его роду. Кто-то пытается планировать будущего ребенка и тестируется на совместимость. Кто-то решил заменить ДНК-тестом диетолога, и получить индивидуальные инструкции, советы по правильному питанию.

Специфика

Специфика всех тестов на основе метода обследования ПЦР в том, что его результаты не могут быть ложноположительными. То есть, если результаты анализа говорят о присутствие ДНК возбудителя болезни, оно точно имеется в пробе. Но из-за такой точности при несоблюдении всего технологического процесса в стерильных условиях, есть риск понести расходы на исследование и провалить его, когда загрязнение будет обнаружено и определено. Что выявляет некоторую слабость методики.

Поэтому, лучше всего обращаться за ДНК-тестирование в специализированную клинику со своей собственной хорошо оборудованной лабораторией. Создание таких учреждений происходит с большими вложениями, как в оборудование, так и в квалифицированный персонал.

Применение ПЦР

Спектр применения технологии полимеразной цепной реакции столь широк, что позволяет проводить различные исследования молекулярно-генетической направленности. Метод используется, как для ДНК-тестов, ставших быстрыми и повседневными, так и для изучения ещё не изученных структур ДНК

И всё благодарят тому, что технология позволяет извлечь из любого количества ДНК интересующий исследователя участок, размножить его и провести глубокий анализ его свойств в различных формах, посредством изучения химических реакций. Таким образом, ПЦР выявляет, позволяет наблюдать зависимости между генами и изучать их совместные реакции на искусственные экспериментальные раздражители.

Проведение ПЦР

ПЦР исследование, что это такое? ПЦР диагностика проводится в специальном аппарате – амплифакторе. Это прибор, в который устанавливаются пробирки с биологическими пробами. В зависимости от исследования амплифактор настраивается на нужное количество циклов и начинает попеременно нагревать и охлаждать пробирки, в которых в это время идут реакции. При этом создаётся однородность температуры по всей внутренней камере, необходимая температура задается буквально в один миг и регулируется с точностью до 0,1 градуса.

Такая точность при нагреве и охлаждении необходима для того, что бы ни превысить пороговые значения и не испортить биоматериал.

Что необходимо для проведения, или, что определяет ПЦР:

  • Буферный раствор;
  • ДНК-матрица с содержанием искомого участка генов для амплификации;
  • Термоустойчивая ДНК-полимераза;
  • Ионы Mg2+;
  • Два коротких фрагмента нуклеиновой кислоты для запуска синтеза комплементарной цепи с помощью ДНК-полимеразы.

Ход реакции

Один цикл реакции протекает в три стадии:

  • Стадия нагревания. Спираль ДНК в пробе нагревается на период от половины до двух минут на 94-96 градусов. Под воздействием высоких температур цепи ДНК распадаются на отдельные фрагменты
  • На второй стадии, как бы вылавливаются необходимые фрагменты с помощью праймеров и сплавляются. Эта стадия проходит при температуре немного ниже, на 4-5 градусов и называется «отжигом». Продолжительность стадии так же варьируется от половины до двух минут.
  • Добавляется специальный фермент для запуска самовоспроизводства (синтеза) «пойманного» участка генов – ДНК-полимераза. И этот фермент запускает реакцию удваивания фрагмента, используя стартовый фрагмент, как матрицу для синтезирования копии. Протекает реакция при 72 градусов от 10 до 12 минут.

Обычно одно исследование составляет от 20 до 35 подобных циклов.

Подготовка материала

Главное при подготовке биоматериала для анализа это собрать его желательно в более стерильном виде — без посторонних примесей. Для этого имеются рекомендации к гигиеническому графику, употребления фармакологических веществ и прочие.

Похожие требования и к транспортировке проб – они должны быть упакованы в подходящие для этого чистые контейнеры, и в некоторых случаях, так же требуется соблюдение особого теплового режима хранения.

Сдача анализов

Анализ методом ПЦР требует особой аккуратности. Поскольку главное требование всей процедуры это идеально чистый образец для пробы, многие анализы сдаются непосредственно в клинике: кровь, другие физиологические жидкости, иногда ткани.

Самый простой метод сбора биоматериала это сбор слюну с внутренней полости рта на ватную палочку. Способ прост, выполняется на дому, но подходит не для всех тестов.

Отдельно протекает подготовка нестандартных образцов, что индивидуально и лучше проконсультироваться у клиники, в каком прядке она их примет.

Подготовка у мужчин

У мужчин нет особенностей при сдаче анализов на различные тесты. Но, в случае тестирование на наличие половых инфекций рекомендуется повышенная интимная гигиена, не менее пары суток воздержания, и не справлять естественные малые потребности за трое часов до процедур.

Читайте также:  Варианты контрацепции

Подготовка у женщин

Для женщин наставлений, запретов и рекомендаций к сдаче несколько больше:

  • Не переусердствовать с интимной гигиеной и не использовать мыла с антибиотиками.
  • Вообще любой прием антибиотиков более чем за 4 недели до сдачи анализов запрещён.
  • Имеются запреты и на специфические интимные средства. Поэтому, для верности соблюдения допусков проще ограничиться стандартной гигиеной. И ограничиться желательно за месяц до сдачи анализов.
  • Запрещена сдача анализов в особо острые дни месячных женских циклов.
  • Запрещаются близкие интимные контакты за 48 часов до проведения процедур.

Расшифровка результатов ПЦР

Когда речь идет всего лишь о выявлении заболевания, из всего спектра возможности полноценной диагностики, расшифровка, как и сам тест довольно просты. Высокая точность анализа позволяет выявить самые незначительные следы присутствия чужеродной ДНК, размножить её до необходимых объемов и исследовать.

С непривычки, такое точное диагностирование, выявляющее заболевания на сверхранней стадии, может вызвать недоверие к результатам. Симптомов нет, самочувствие хорошее, а результаты теста говорят об обратном. Если в теме о проблемах здоровья можно, как-то говорить о везении, то выявить заболевание так рано и сразу начать его лечение — это своего рода удача.

Тем временем за расшифровкой каждого известного гена стоят десятилетия непрерывных исследований ведущих университетов разных стран мира. Например, один из самых длительных из известных исследовательских проектов, проект «геном человека», продолжался без малого 13 лет к ряду. За время проведения только этих исследований было изучено около 25 тысяч генов, составляющих человеческую ДНК.

Проверка на ВИЧ

У ДНК-анализа не ВИЧ имеется несколько специфических особенностей и рекомендаций:

  1. Если произошел нежелательный контакт с ВИЧ инфицированным человеком, то анализы на проведение диагностики необходимо сдавать не ранее 14 суток, после него.
  2. Во время проведения диагностирования в образце происходит поиск не ДНК-вируса, а клеток им уже поврежденных. Эти клетки несут в себе специфическую вирусную информацию, которая самокопируется в незаражённые клетки.
  3. Хоть синдром иммунодефицита и остаётся одной из самый опасных болезней. Но, период истерии средств массовой информации по её поводу сильно омрачил её, и без того опасные особенности. Заразность даже при попадании инфицированной крови в кровь здоровую составляет 85%, что много не 100%. При прочих же контактах она составляет не более чем от 1% до 10%.
  4. Сроки получения готовых результатов анализов находятся в пределах от 4 до 7 дней.

Опубликовано 23 Май 2018 пользователем admin

Горизонтальные табы

Флороценоз NCMT – комплексная диагностика Realtime ПЦР-методом клинически значимых патогенных возбудителей инфекций, передающихся половым путем. NCMT – это аббревиатура четырех микроорганизмов:

  • Neisseria gonorrhoeae (гонорея)
  • Chlamydia trachomatis (хламидиоз)
  • Mycoplasma genitalium (микоплазмоз)
  • Trichomonas vaginalis (трихомониаз)

Данные микроорганизмы объединены в одну группу, так как они не должны присутствовать в нормальной микрофлоре ?здорового мочеполового тракта, в отличие от уреаплазмы (U.species), гарднереллы (G. vaginalis), кандид (C. albicans) и микоплазмы хоминис (M.hominis), наличие которых в незначительном количестве допустимо. Обнаружение NCMT-инфекции в соскобе является прямым показанием для медикаментозного лечения вне зависимости от наличия жалоб или симптомов.

При первичной диагностике половых инфекции необходимо одномоментное обнаружение сразу всех вероятных возбудителей, неполный спектр – недопустим. Это обусловлено тем, что каждый микроорганизм уничтожается определенным антибиотиком: универсального метода лечения, подходящего для всех патогенов сразу – не существует!

Флороценоз NCMT успешно прошел клиническое испытание относительно эталонного референсного теста CDC*, и по некоторым параметрам даже превзошел его. В целом, чувствительность и достоверность теста составляет 99%, что существенно выше иных методов (ИФА, РИФ).

Еще одним неоспоримым качеством анализа является его низкая цена, в сравнении с аналогичными ПЦР-методами обнаружения отдельных возбудителей.

Опасность ЗППП заключается в высокой вероятности развития осложнений: бесплодия, передачи инфекции новорожденным, тяжелых нагноительных процессов в малом тазу или присоединения ряда неспецифических воспалительных заболеваний. Например, у женщин это может быть?:

  • Вульвовагинальный кандидоз
  • Условно-патогенный микоплазмоз и уреаплазмоз
  • Бактериальный вагиноз
  • Аэробный вагинит

Перечисленные заболевания относятся к категории тех болезней, которые могут переходить в хронические формы и сопровождать женщин годами, поскольку малейшее переохлаждение приводит к обострению инфекционного процесса.

Тест «Флороценоз NCMT», прежде всего, показан при наличии наиболее вероятных симптомов половых инфекций:

  • Выделения из половых органов
  • Зуд в области половых органов
  • Боли внизу живота
  • Боли при половом контакте
  • Боли при мочеиспускании

* Domeika, M. et al. World Congress of Sexually Transmitted Infections and AIDS, New Deli, 2011

Ссылка на основную публикацию
Пульс 110 в спокойном состоянии
Пульс (от лат. pulsus — удар, толчок) — периодические, связанные с сокращениями сердца, колебания стенок сосудов, обусловленные динамикой их кровенаполнения...
Псевдоузел щитовидной железы что это такое
Опасны ли псевдоузлы в щитовидке и как от них избавиться Псевдоузлы щитовидной железы – это доброкачественные новообразования, которые вызваны нарушением...
Псиллиум как применять
Псиллиум обладает эндоэкологическим действием, т.е. стимулирует отток межклеточной жидкости, содержащей токсины, в лимфатические капилляры. Псиллиум (подорожник блошный) - это водорастворимое,...
Пульс 134 удара в минуту что делать
Человек, который умеет определить повышение пульса и вовремя принять необходимые меры, может спасать жизни. Определить у человека высокий пульс можно...
Adblock detector